野生稻-栽培稻泛基因組圖譜。（中國科學院分子植物科學卓越創新中心供圖）

4月16日，國際權威學術期刊《自然》（Nature）在線發表了相關研究論文。這是韓斌院士團隊繼2012年全面解析水稻馴化路線、2018年構建首個栽培稻-野生稻泛基因組草圖之后，在水稻基因組研究和進化領域取得的又一項重大突破，對未來保障糧食安全具有重要意義。

韓斌介紹，亞洲栽培稻是全球數十億人的主糧，其馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”，是破解糧食安全困局的重大課題。急需構建一個高質量、大規模的野生稻泛基因組，深度解析其廣泛的多樣性，全面挖掘其耐逆、抗病等優良性狀的遺傳變異寶庫。

研究團隊整合了具有代表性的129份普通野生稻和16份亞洲栽培稻資源，進行高質量的基因組測序和從頭組裝，構建了一個可以覆蓋野生稻和栽培稻全面遺傳景觀的泛基因組圖譜。

與原有公認的單個參考基因組相比，“栽培稻-野生稻泛基因組”新增了38.7億個堿基對，共包含69531個基因，其中近20%為野生稻特有，這些基因被證實與抗病防御、環境適應性等性狀密切相關。

深入研究發現，野生稻中的抗病基因豐度和多樣性均明顯高于栽培稻，進一步證實了野生稻堪稱作物改良的“戰略資源庫”，可為培育抗病耐逆的水稻品種提供直接的基因來源；研究證明所有亞洲栽培稻的馴化位點均來源于粳稻祖先Or-Ⅲa，進一步證實亞洲栽培稻單起源假說，為持續數十年的學術爭議提供了關鍵證據。

研究還發現在南亞各栽培稻類群之間存在廣泛的基因交流，并由此定義了一個新的栽培稻亞群，成功繪制了一幅更全面的水稻進化和馴化路線圖。